Partidul Democrat din Moldova a fost înfiinţat în 1997 sub denumirea "Mişcarea pentru o politică o Moldovă Democratică şi Prosperă". Congresul din 17 octombrie 1998 a ales organele de conducere ale partidului şi a adoptat Statutul şi Programul Politic bazat pe principiile social-democraţiei. La alegerile parlamentare din 1998, Mişcarea pentru o Moldovă Democratică şi Prosperă a obţinut 18.64% din voturi (24 din 101 locuri în Parlament). Dumitru Diacov, preşedintele formaţiunii, a fost ales ca speaker al legislativului.
La Congresul din 15 aprilie 2000 Mişcarea pentru o Moldovă Democrată şi Prosperă şi-a schimbat denumirea în Partidul Democrat din Moldova. Partidul Democrat şi-a reafirmat dedicaţia sa pentru idealurile şi valorile social-democraţiei moderne, atât în acţiunile sale politice curente cât şi în actul de conducere. La alegerile parlamentare din 2001, partidul a obţinut 79 757 voturi (5.02%), dar nu a reuşit să treacă pragul electoral de 6%. În ciuda acestui fapt, la alegerile locale din 25 mai 2003 PDM a reuşit sa obţină aproximativ 8.3% pe ţară, astfel arătând consolidare şi susţinere crescândă din partea populaţiei.
Congresul partidului din 22 noiembrie 2003 a stabilit sarcini noi în activitatea formaţiunii. Unul din documentele de bază adoptate la Congres a fost noua redacţie a Programului Politic, unde partidul declară caracterul invariabil al scopurilor şi principiilor sale politice. La Congres Partidul Democrat şi-a declarat intenţia de a deveni membru al Internaţionalei Socialiste şi a adoptat Rezoluţia ce ţine de relaţia Partidului Democrat din Moldova cu mişcarea sindicală. La 8 mai 2004, reacţionând la aşteptările electoratului ce ţineau de consolidarea forţelor reformatoare şi democrate, Partidul Democrat din Moldova , Alianţa "Moldova Noastră" şi Partidul Social-Liberal au creat Blocul "Moldova Democrată" (BMD). În urma alegerilor parlamentare din 6 martie 2005 PDM obţine 8 locuri în parlament, fiind singurul partid ce a pierdut alegerile în 2001 şi a reuşit să-şi întoarcă reprezentanţa în parlament în 2005. După aderarea grupului deputaţilor PSL la grupul parlamentar al PDM numărul deputaţilor democraţi a crescut la 11, PDM devenind a treia forţă politică în legislativul de la Chişinău.
În urma alegerilor parlamentare din 29 iulie 2009 PDM a obţinut 13 mandate de deputat, devenind în scurt timp una din cele patru componente ale Alianţei pentru Integrare Europeană, care deţine majoritatea în Parlamentul Republicii Moldova. Marian Lupu, liderul PDM, a fost candidatul Alianţei pentru Integrare Europeană la funcţia de Preşedinte al Republicii Moldova la alegerile din 10 noiembrie şi 7 decembrie 2009, dar nu a întrunit numărul necesar de voturi.
